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靶向膜蛋白的抗体药物开发的新进展 Review

Georgina To’a Salazar, 黄子逸, 张凝艳, 张学光, 安志强

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第11期   页码 1541-1551 doi: 10.1016/j.eng.2020.11.013

摘要:

在疾病干预的众多膜蛋白靶标中,G蛋白偶联受体(GPCR)作为人体内最大的膜受体蛋白家族,成为很多药物的重要靶点,其次是离子通道、转运蛋白和激酶等膜蛋白在细胞信号转导和运输中发挥了关键作用,当前药物研发面临的挑战在于进一步发掘此类膜蛋白的潜在靶点的干预价值,开发治疗性抗体药物。鉴于特异性抗体能够识别膜蛋白的灵敏特性,以及随着基因工程技术的进步,对已有抗体进行加工改造可获得适应多个靶点蛋白的特异性抗体。然而,成功分离特异靶向膜蛋白抗体取决于一系列因素。我们更易研制和识别结构简单且具有长片段胞外区的抗体分子,但对于高难度的靶点蛋白,如GPCR和其他复杂膜蛋白往往难以得到具有活性的候选抗体。深入研究靶标膜蛋白的结构有助于推进治疗性抗体药物的开发进程。本文概述了抗体靶向复杂膜蛋白的优势和挑战,以及膜蛋白抗原制备和抗体研发策略的最新进展。

关键词: 抗体治疗     复杂膜蛋白     离子通道     转运蛋白     膜结合酶     G蛋白偶联受体     药物发现    

人工智能加速GPCR配体的发现 Review

陈伟, 宋驰, 冷梁, 张三印, 陈士林

《工程(英文)》 2024年 第32卷 第1期   页码 19-29 doi: 10.1016/j.eng.2023.09.011

摘要:

G蛋白偶联受体(GPCR)在多种生理过程中发挥着关键作用,是新药发现的重要靶标。

关键词: G蛋白偶联受体     配体     人工智能     多组学     药物发现    

流感与COVID-19患者的免疫球蛋白G糖基化差异 Article

Marina Kljaković-Gašpić Batinjan, Tea Petrović, Frano Vučković, Irzal Hadžibegović, Barbara Radovani, Ivana Jurin, Lovorka Đerek, Eva Huljev, Alemka Markotić, Ivica Lukšić, Irena Trbojević-Akmačić, Gordan Lauc, Ivan Gudelj, Rok Čivljak

《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期   页码 54-62 doi: 10.1016/j.eng.2022.08.007

摘要:

The essential role of immunoglobulin G (IgG) in immune system regulation and combatting infectious diseases cannot be fully recognized without an understanding of the changes in its N-glycans attached to the asparagine 297 of the Fc domain that occur under such circumstances. These glycans impact the antibody stability, half-life, secretion, immunogenicity, and effector functions. Therefore, in this study, we analyzed and compared the total IgG glycome—at the level of individual glycan structures and derived glycosylation traits (sialylation, galactosylation, fucosylation, and bisecting N-acetylglucosamine (GlcNAc))—of 64 patients with influenza, 77 patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19), and 56 healthy controls. Our study revealed a significant decrease in IgG galactosylation, sialylation, and bisecting GlcNAc (where the latter shows the most significant decrease) in deceased COVID-19 patients, whereas IgG fucosylation was increased. On the other hand, IgG galactosylation remained stable in influenza patients and COVID-19 survivors. IgG glycosylation in influenza patients was more time-dependent: In the first seven days of the disease, sialylation increased and fucosylation and bisecting GlcNAc decreased; in the next 21 days, sialylation decreased and fucosylation increased (while bisecting GlcNAc remained stable). The similarity of IgG glycosylation changes in COVID-19 survivors and influenza patients may be the consequence of an adequate immune response to enveloped viruses, while the observed changes in deceased COVID-19 patients may indicate its deviation.

关键词: 流行性感冒     COVID-19     病毒感染     糖基化     免疫球蛋白G     肺炎    

免疫球蛋白G N-糖基化与代谢特征之间的双向因果关联——一项孟德尔随机化研究 Article

孟晓妮, 曹维杰, 刘迪, Isinta Elijah Maranga, 邢薇佳, 侯海峰, 徐希柱, 宋曼殳, 王友信

《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期   页码 74-88 doi: 10.1016/j.eng.2022.11.004

摘要:

既往研究已发现免疫球蛋白 G(immunoglobulin G, IgG)N-糖基化与代谢特征之间存在关联,但它们之间是否存在因果关联尚有待研究相应地,对整合代谢特征-QTL-遗传变异与GWAS结果和 IgG N-糖基进行MR分析的结果显示,在单样本和两样本MR研究中,分别发现72个包括影响GP1的1个因果代谢特征[高密度脂蛋白胆固醇

关键词: 孟德尔随机化研究     免疫球蛋白 G     N-糖基化     代谢特征     数量性状位点     双向因果关联    

月经周期中免疫球蛋白G N-糖基化的周期性变化 Article

Julija Jurić, Hongli Peng, Manshu Song, Frano Vučković, Jelena Šimunović, Irena Trbojević-Akmačić, Youxin Wang, Jiaonan Liu, Qing Gao, Hao Wang, Qiaoyun Chu, Marija Pezer, Wei Wang, Gordan Lauc

《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期   页码 108-118 doi: 10.1016/j.eng.2022.10.020

摘要:

Immunoglobulin G (IgG) is the most abundant plasma glycoprotein and a prominent humoral immune mediator. Glycan composition affects the affinity of IgG to ligands and consequent immune responses. The modification of IgG N-glycosylation is considered to be one of the various mechanisms by which sex hormones modulate the immune system. Although the menstrual cycle is the central sex hormone-related physiological process in most women of reproductive age, IgG N-glycosylation dynamics during the menstrual cycle have not yet been investigated. To fill this gap, we profiled the plasma IgG N-glycans of 70 healthy premenopausal women at 12 time points during their menstrual cycles (every 7 days for 3 months) using hydrophilic interaction ultra-performance liquid chromatography (HILIC-UPLC). We observed cyclic periodic changes in the N-glycosylation of IgG in association with the menstrual cycle phase and sex hormone concentration in plasma. On the integrated cohort level, the modeled average menstrual cycle effect on the abundance of IgG N-glycosylation traits was low for each trait, with the highest being 1.1% for agalactosylated N-glycans. However, intrapersonal changes were relatively high in some cases; for example, the largest difference between theminimum and maximum values during themenstrual cycle was up to 21% for sialylated N-glycans. Across all measurements, the menstrual cycle phase could explain up to 0.72% of the variation in the abundance of a single IgG glycosylation trait of monogalactosylation. In contrast, up to 99% of the variation in the abundance of digalactosylation could be attributed to interpersonal differences in IgG N-glycosylation. In conclusion, the average extent of changes in the IgG N-glycopattern that occur during the menstrual cycle is small; thus, the IgG N-glycoprofiling of women in large sample-size studies can be performed regardless of menstrual cycle phase.

关键词: N-糖基化     免疫球蛋白G     月经周期     女性性激素     雌激素     孕 酮     睾酮     妇女    

血清免疫球蛋白G N-糖基的高通量分析——一种消化道癌症的非侵入性生物标志物 Article

刘鹏程, 王小兵, 顿爱社, 李昱潼, 李厚强, 王璐, 张怡春, 李灿灿, 张金霞, 张晓雨, 马立兴, 侯海峰

《工程(英文)》 2023年 第26卷 第7期   页码 44-53 doi: 10.1016/j.eng.2023.02.008

摘要:

免疫球蛋白G (Immunoglobulin G, IgG) 的 N-糖基化在炎症性疾病的发展中起着重要作用。本研究旨在评价IgG N-糖基在消化道癌症亚型中的诊断效能。

关键词: 消化道癌症     糖基化     免疫球蛋白 G     诊断生物标志物    

适用于面制品蛋白营养强化的新型大豆蛋白

李荣和,姜浩奎

《中国工程科学》 2003年 第5卷 第3期   页码 72-74

摘要:

采用大豆功效成份连续提取、逆向留存大豆蛋白技术,生产新型大豆浓缩蛋白(纯度≥70%)可将大豆浓缩蛋白成本降至<0.22万元/t,是国内外同类产品成本的1/3,在面粉中添加5%~8%新型大豆浓缩蛋白,可使面制主食中大豆蛋白含量提高3.5%~5.6%,而且可全面改善面制主食的品质,不增加面粉与面制主食的售价。

关键词: 大豆蛋白     浓缩蛋白     高变性    

中东呼吸综合征病毒(MERS-CoV)蛋白的分子特征、功能及其致病性 Review

李艳华, 胡晨雨, 吴南屏, 姚航平, 李兰娟

《工程(英文)》 2019年 第5卷 第5期   页码 940-947 doi: 10.1016/j.eng.2018.11.035

摘要: 除了完整人免疫球蛋白G(IgG)多克隆抗体(SAB-301)的安全性和耐受性得到一定的验证之外,目前尚无其他针对MERS-CoV的有效的预防性疫苗或抗体特效治疗手段。为此,我们需要明确MERS-CoV各种蛋白的详细信息。在文中论述了MERS-CoV的主要结构蛋白和非结构蛋白,并总结了抑制MERS-CoV感染的各种潜在的策略。

关键词: MERS-CoV     刺突蛋白     结构蛋白     辅助蛋白     非结构蛋白    

CO气相偶联制草酸模拟放大研究

王保伟,马新宾,李振花,许根慧

《中国工程科学》 2001年 第3卷 第2期   页码 79-85

摘要:

CO气相偶联制草酸为多步反应循环系统。在评选出最佳催化剂及理论研究的基础上,利用模拟计算、催化剂工程研究和模试运转对CO气相偶联合成草酸二乙酯的工程问题进行了研究,解决了偶联反应和再生反应速率匹配的关键技术。在反应动力学和反应参数敏感性分析的基础上,经模试1000小时连续运转,解决了复杂反应的非线性多步循环的速率匹配,并建立了零排放洁净工艺过程;研制的催化剂适用于CO偶联反应工业放大工程,为工业生产提供了一条绿色化学工艺路线

关键词: CO     偶联     草酸     模试放大     催化剂工程    

假单胞菌环状脂肽Medpeptin的生物合成及其调控植物免疫的作用机制 Article

谷医林, 李俊州, 李彦, 从珅, 王静, 马毅楠, 魏海雷

《工程(英文)》 2023年 第28卷 第9期   页码 153-165 doi: 10.1016/j.eng.2023.05.016

摘要: 结果显示,当沉默本氏烟中细胞壁富含亮氨酸的重复延伸蛋白NbLRX3或类受体蛋白激酶NbRLK25后,medpepatin触发的细胞死亡和对病原细菌的抗性受到严重影响,而沉默BAK1或SGT1则并未影响这一表型

关键词: 假单胞菌     环状脂肽     细胞死亡     富含异亮氨酸的延伸蛋白     受体激酶    

蛋白日粮中添加亮氨酸通过雷帕霉素靶蛋白信号通路增加成年大鼠骨骼肌重量及蛋白质合成

张博, 楚丽翠, 刘宏, 谢春元, 谯仕彦, 曾祥芳

《工程(英文)》 2017年 第3卷 第5期   页码 760-765 doi: 10.1016/J.ENG.2017.03.008

摘要:

蛋白日粮会减少动物组织中蛋白质沉积,影响骨骼肌增重。本文旨在研究低蛋白日粮中添加亮氨酸对成年大鼠骨骼肌重量和蛋白质合成的影响。试验选取36只平均体重为(214.4 ± 2.4)g的成年SD雄性大鼠,按体重相近原则平均分为3个处理,每个处理12个重复,每个重复1只大鼠。3个处理分别饲喂20%酪蛋白(20%C,CON)、10%酪蛋白 + 丙氨酸(10%C + Ala,R)以及10%酪蛋白 + 亮氨酸(10%C + Leu,RL)日粮,试验期为11 d,其中,10%C +与R组相比,RL组可以增加腓肠肌重量(P < 0.05),促进S6K1磷酸化(P < 0.05),增加骨骼肌蛋白质合成(P < 0.05)。本文结论如下,在成年大鼠长期采食低蛋白日粮的情况下,日粮中添加亮氨酸可以改善大鼠的生长性能,通过提高mTOR通路中S6K1磷酸化水平,促进大鼠骨骼肌蛋白质合成,抑制蛋白质降解。

关键词: 蛋白日粮     亮氨酸     生长性能     肌肉重量     蛋白质合成     成年大鼠    

羊种布鲁氏菌双抗原纳米结合疫苗的生物合成与免疫效果评估 Article

黄竞, 王玉飞, 王康丰, 李淑磊, 孙鹏, 郭艳, 刘建凯, 杨瑞馥, 曾明, 潘超, 王恒樑, 朱力

《工程(英文)》 2023年 第29卷 第10期   页码 95-109 doi: 10.1016/j.eng.2023.04.007

摘要: 在本研究中,我们开发了一种含有多糖和蛋白质两种抗原的双抗原纳米结合疫苗来对抗布鲁氏菌感染。首先,我们使用蛋白-聚糖生物偶联技术将抗原多糖与外膜蛋白Omp19共价偶联,然后通过SpyTag/SpyCatcher系统将其装载到纳米载体上。据我们所知,这是第一种在单个纳米颗粒上携带多种布鲁氏菌抗原(包括蛋白质和多糖)的布鲁氏菌病疫苗。因此,我们还提出了一种有吸引力的技术以共同递送不同类型的抗原,这也适用于其他传染病疫苗的制备策略。

关键词: 蛋白-聚糖偶联技术(PGCT)     双抗原     纳米结合疫苗     羊种布鲁氏菌    

保障国家粮食安全的蛋白替代战略构想

浦华 ,杨静 ,王永伟 ,涂涛 ,李燕松 ,罗会颖 ,姚斌

《中国工程科学》 2023年 第25卷 第4期   页码 149-157 doi: 10.15302/J-SSCAE-2023.04.003

摘要: 本文着眼“保障粮食安全、实现蛋白稳定供给”的宏观需求,梳理了我国蛋白饲料资源的利用现状,凝练了蛋白饲料供给面临的主要问 题;在测算国内蛋白饲料资源、辨识国际市场蛋白供求潜力的基础上进一步提高现有蛋白资源的利用率、积极寻找新的蛋白源、开辟新的蛋白饲料资源,是缓解我国蛋白资源短缺的有效途径。A , Falcucci A , Tempio G , al e t ‍.

针对于此,本文梳理蛋白饲料资源基本情况、分析饲料蛋白替代潜力、提出蛋白替代战略构想,以期为增强蛋白饲料资源的有效供给提供借鉴。代谢工程为基础的新型饲用氨基酸及其衍生物高产新菌株[ 关键词: 粮食安全;蛋白饲料资源;蛋白替代;豆粕    

嵌合抗原受体和调节性T细胞——移植中人类白细胞抗原特异性免疫抑制的潜力 Review

Sabrina Wright, Conor Hennessy, Joanna Hester, Fadi Issa

《工程(英文)》 2022年 第10卷 第3期   页码 30-43 doi: 10.1016/j.eng.2021.10.018

摘要:

嵌合抗原受体(CAR)是基因工程领域的一项突破,它彻底改变了过继细胞疗法(ACT)领域。表达这些受体的细胞通过在合成的CAR构建体中包含抗原特异性结合区域而被重新定向到预定的靶点。

关键词: 嵌合抗原受体(CAR)     调节性T细胞     异性免疫     CAR设计     基因编辑    

新型冠状病毒HCoV-19 S蛋白与人ACE2蛋白表面糖链和独特翻译后修饰的质谱分析 Article

孙泽宇, 任科燚, 张兴, 陈景华, 姜正一, 江静, 季飞洋, 欧阳晓希, 李兰娟

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第10期   页码 1441-1451 doi: 10.1016/j.eng.2020.07.014

摘要: 质谱分析(MS)发现,在HCoV-19 S蛋白的21个潜在糖基化修饰位点中,有20个位点完全被N-糖链占据,其糖型以低聚甘露糖为主。然而,糖基化修饰并不能直接影响HCoV-19 S蛋白与hACE2之间的结合亲和力。另外,我们还发现了S蛋白和hACE2的多个甲基化修饰位点,以及hACE2的多个羟脯氨酸修饰位点。通过在最近发表的冷冻电镜(cryo-EM)结构的基础上加入N-糖链和蛋白质翻译后修饰(PTM),我们构建了HCoV-19 S蛋白和hACE2的精细结构模型。本研究揭示的HCoV-19 S蛋白和hACE2的PTM及糖基化图谱为研究病毒的宿主黏附、免疫反应,以及相关药物和疫苗的研发提供了更多的蛋白质结构细节。

关键词: N-糖基化     COVID-19     棘突蛋白     hACE2     蛋白结构    

标题 作者 时间 类型 操作

靶向膜蛋白的抗体药物开发的新进展

Georgina To’a Salazar, 黄子逸, 张凝艳, 张学光, 安志强

期刊论文

人工智能加速GPCR配体的发现

陈伟, 宋驰, 冷梁, 张三印, 陈士林

期刊论文

流感与COVID-19患者的免疫球蛋白G糖基化差异

Marina Kljaković-Gašpić Batinjan, Tea Petrović, Frano Vučković, Irzal Hadžibegović, Barbara Radovani, Ivana Jurin, Lovorka Đerek, Eva Huljev, Alemka Markotić, Ivica Lukšić, Irena Trbojević-Akmačić, Gordan Lauc, Ivan Gudelj, Rok Čivljak

期刊论文

免疫球蛋白G N-糖基化与代谢特征之间的双向因果关联——一项孟德尔随机化研究

孟晓妮, 曹维杰, 刘迪, Isinta Elijah Maranga, 邢薇佳, 侯海峰, 徐希柱, 宋曼殳, 王友信

期刊论文

月经周期中免疫球蛋白G N-糖基化的周期性变化

Julija Jurić, Hongli Peng, Manshu Song, Frano Vučković, Jelena Šimunović, Irena Trbojević-Akmačić, Youxin Wang, Jiaonan Liu, Qing Gao, Hao Wang, Qiaoyun Chu, Marija Pezer, Wei Wang, Gordan Lauc

期刊论文

血清免疫球蛋白G N-糖基的高通量分析——一种消化道癌症的非侵入性生物标志物

刘鹏程, 王小兵, 顿爱社, 李昱潼, 李厚强, 王璐, 张怡春, 李灿灿, 张金霞, 张晓雨, 马立兴, 侯海峰

期刊论文

适用于面制品蛋白营养强化的新型大豆蛋白

李荣和,姜浩奎

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中东呼吸综合征病毒(MERS-CoV)蛋白的分子特征、功能及其致病性

李艳华, 胡晨雨, 吴南屏, 姚航平, 李兰娟

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王保伟,马新宾,李振花,许根慧

期刊论文

假单胞菌环状脂肽Medpeptin的生物合成及其调控植物免疫的作用机制

谷医林, 李俊州, 李彦, 从珅, 王静, 马毅楠, 魏海雷

期刊论文

蛋白日粮中添加亮氨酸通过雷帕霉素靶蛋白信号通路增加成年大鼠骨骼肌重量及蛋白质合成

张博, 楚丽翠, 刘宏, 谢春元, 谯仕彦, 曾祥芳

期刊论文

羊种布鲁氏菌双抗原纳米结合疫苗的生物合成与免疫效果评估

黄竞, 王玉飞, 王康丰, 李淑磊, 孙鹏, 郭艳, 刘建凯, 杨瑞馥, 曾明, 潘超, 王恒樑, 朱力

期刊论文

保障国家粮食安全的蛋白替代战略构想

浦华 ,杨静 ,王永伟 ,涂涛 ,李燕松 ,罗会颖 ,姚斌

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嵌合抗原受体和调节性T细胞——移植中人类白细胞抗原特异性免疫抑制的潜力

Sabrina Wright, Conor Hennessy, Joanna Hester, Fadi Issa

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新型冠状病毒HCoV-19 S蛋白与人ACE2蛋白表面糖链和独特翻译后修饰的质谱分析

孙泽宇, 任科燚, 张兴, 陈景华, 姜正一, 江静, 季飞洋, 欧阳晓希, 李兰娟

期刊论文